L’exploitation est la gestion des circulations sur les différentes voies affectées à la ligne.

Il ne s’agit pas seulement de faire circuler les RER d’un terminus à l’autre, en suivant les horaires de référence.

Il faut en effet gérer:

• les relèves de conducteurs en fin de service
• les défauts des matériels et leur maintenance prévue ou non
• les périodes de travaux
• les défauts de l’infrastructure (rails, signalisation, …)
• les actes de vandalisme
• les accidents matériels (exemple : collision avec un sanglier, ou une pelleteuse, …)
• les colis abandonnés nécessitant l’intervention des démineurs
• les interférences avec les autres circulations (ligne R, TER Bourgogne, TER Picardie, trains de messagerie ou de fret, Corail Intercités, TGV, Thalys, Eurostar, mais aussi trains circulant à vide ou locomotives seules (haut-le-pied)
• et bien d'autres événements

bref tout ce qui distingue la théorie et la réalité.

Les infrastructures étant une ressource limitée par définition, il peut s’agir dans de nombreux cas de gérer au mieux (ou au moins pire) la pénurie.

L’exploitation de la ligne D est assurée :

• en Gare du Nord et au nord de cette gare, par la région Paris-Nord SNCF
• au sud de Châtelet Les Halles, par la région Paris-Sud-Est SNCF
• sur l’ensemble de ces 2 zones, en liaison avec les régions citées par le Centre Opérationnel Transilien (COT) SNCF
• à Châtelet Les Halles et dans le tunnel entre cette gare et la Gare du Nord par la RATP (PCC, poste de commandement centralisé de Denfert-Rochereau de la ligne B partie RATP)

en liaison avec les postes d'aiguillage répartis le long de la ligne, les postes d'information voyageurs, les sites de maintenance, ...

L’exploitation de la section centrale de la ligne D ne représente donc qu’une petite partie du travail du PCC de Denfert, qui se consacre principalement aux sections Gare du Nord – Châtelet-les-Halles - Denfert-Rochereau - Massy-Palaiseau – St-Rémy-lès-Chevreuse et Bourg La Reine – Robinson de la ligne B.

Afin de réduire la faille existant entre les domaines RATP et SNCF, plusieurs aménagements ont été mis en place fin 2008 / début 2009:

• installation d'un responsable de l'information voyageurs dédié ligne D dans le centre d'exploitation de la gare de Châtelet les Halles. La personne présente peut communiquer aux usagers des quais 3 et 4 les informations relatives aux trains à l'approche, aux incidents et aux retards
• installation d'agents SNCF dans l'enceinte du PCC RATP de Denfert-Rochereau. Ces agents sont chargés d'assurer le transfert d'informations entre le PCC RATP et les centres de régulation SNCF. Cette mesure est temporaire en attendant la mise en place du CUB (Centre Unique ligne B) qui sera chargé de la régulation de l'ensemble de la ligne B (sections RATP et SNCF).